慢性胃脹氣、嗝氣、胃食道逆流、便秘、排便次數增加或常拉肚子、大腸激躁症等症狀，都屬於功能性的腸胃疾病。這是一個歸納症狀的診斷，並沒有告訴我們疾病的根源是什麼? 只是，如果不知道根源，怎麼治得好?

醫院治療功能性腸胃疾病的藥，都是強迫腸胃蠕動、或抑制腸胃痙攣、或中和胃酸（制酸劑）或抑制胃酸分泌...，以遮蔽症狀。雖然有可能迅速減輕不舒服的感覺，但是疾病仍然存在，疾病沒有得到任何的治療，於是當藥物代謝排出之後，症狀減輕的假相便會消失，所以醫師會要求患者一定要持續地長期地服藥，但患者卻常常越吃藥越嚴重。

吃胃藥的結果，導致胃內酸鹼值提高，營養吸收下降，容易引發骨質疏鬆症，疲勞等症狀，且腸道壞菌滋生反而惡化，更加重腸道發炎及加速後續症狀的出現，例如肩頸僵硬、頭暈、痠痛、心悸、胸悶、焦慮、失眠、內分泌異常、抵抗力下降、皮膚過敏等等。再者，大部分制酸劑都含有鋁，而鋁屬於具有蓄積體內特性的有毒金屬。

事實上，包括胃脹氣、消化不良、胃酸逆流、胃潰瘍等許多腸胃症狀或疾病，其相對根源來自腸道內的菌叢異常，也就是說，腸道內的壞菌太多，而可以保護腸道促進消化的好菌卻不夠，更進一步追根究底，原因與腸胃道受到毒素累積、慢性感染，高頻電磁波等傷害，使得免疫功能逐漸降低有關，要根本治療，就必須從這些問題來著手。

功能性腸胃疾病不會單獨發生，當病根持續進展，一段時間之後，有可能引起癌症，或各種過敏性疾病、或青春痘、或關節痠痛、或失眠、或焦慮、或經常性口瘡、或肝功能異常、或內分泌異常、或肥胖、或抵抗力減退...等症狀，此時，慢性食物過敏、腸漏症（leaky gut syndrome）、或是麩質敏感性腸病變（或腹腔疾病，gluten sensitive enteropathy or celiac disease），都是需要列入鑑別診斷的。

胃鏡大腸鏡有用嗎？

胃鏡和大腸鏡只能觀察腸道內的表象，看看有沒有發炎或潰瘍或腫瘤，但並不能得知疾病的原因，即使做了切片也是一樣，就好比皮膚科醫師可以拿放大鏡把異位性皮膚炎或慢性蕁麻疹患者的皮膚看得清清楚楚，切片也很容易，但卻只能了解疾病的表徵，因而沒有辦法治癒它們。